O Instituto de Estudos, Pesquisas e Projetos da UECE (Iepro) apoia o desenvolvimento institucional através de projetos diversos. Liderado pela Diretoria Executiva e um Conselho Deliberativo, possui gerências como a de Projetos, Cursos, Administração (Pessoal, Patrimonial e Documental) e Finanças, além da Coordenadoria jurídica e de Comunicação, que integram esforços para atender às demandas acadêmicas e regionais.